本发明提供一种含氟有机硅树脂改性基体材料及其制备方法与应用。本发明方法包括步骤:将三氟丙基三甲氧基硅烷溶于有机溶剂a中,滴加酸催化剂的水溶液,滴加完毕后搅拌均匀:静置反应,然后经过滤、洗涤、干燥得到含氟有机硅树脂;将含氟有机硅树脂和氰基丙烯酸乙酯溶于有机溶剂b中,得到涂层改性液B;将涂层改性液B涂覆于基底表面,经干燥即得。本发明耗费原材料较少,制备方法简单易行,低能耗,低成本;可对多种基材进行性能优化处理;改性所得的材料有着良好的机械和化学稳定性,大大提高了材料的使用寿命,其中改性海绵在疏水性能方面有着极大的提升,在油水分离或抗水污领域具有潜在的应用。